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生物化學

利用合成生物學重建酵母菌性別轉換系統

本研究旨在解決摩爾定律和庫梅定律的困境,利用合成生物学將酵母菌配型變換的特性改變為一種運算機制。首先,以HO內切酶切割不同配型的酵母菌(MATa和MATα)染色體使其進行配型變換,並用顯微鏡檢視是否達成交配和計算效率。其次,利用同源重組將製造必需胺基酸(TRP1和HIS3)的基因替換配型變換中會置換的配型基因(a和α),將酵母菌配型變換改造為二進位生物運算單元。本實驗設計了引子用於PCR確認酵母菌第三條染色體中是否準確插入TRP1/ HIS3序列。目前成功以HIS3基因轉殖重建酵母菌的配型。這項研究為隨後涉及不同配型變換以及利用CRISPR系統進行計算應用的更廣泛研究提供了基礎。

利用果蠅視覺系統探討不同Cullin在阿茲海默症毒性下對於PAICS泛素化形成嘌呤體的影響

據 WHO 於 2023 的統計,全球約有四千萬人罹患阿茲海默症,且近年來患病率逐年上升,已成為當今無法避免的疾病。造成阿茲海默症的因子眾多,目前著重研究 Tau 蛋白毒性與其的關係。前人研究發現真核生物缺乏嘌呤時會形成嘌呤體,而嘌呤體始於 PAICS 泛素化,Cullin 在其中擔任重要角色,然而現今仍未得知哪些 Cullin 與 PAICS 泛素化較有關聯,故本研究以黑腹果蠅為實驗模型,用 T- test 統計數據並探討不同 Cullin 在阿茲海默症毒性下對於 PAICS 泛素化形成嘌呤體的影響。根據實驗結果,本研究發現 Cullin3 的複眼面積顯著變小,推測其最可能和 PAICS 泛素化有關聯;而與預期相反的是 Cullin5、6,結果顯示其果蠅複眼面積皆顯著大於對照組。本研究結果可提供 Cullin3 對阿茲海默症研究扮演重要角色。

以限制酶酵素切位多樣性檢驗臺灣入侵紅火蟻基因體重組事件

入侵紅火蟻( Solenopsis invicta,以下簡稱紅火蟻) 起源於南美洲巴拉那河流域,其對於農業、畜牧業、甚至對人的健康都具有高度危險性及破壞性。由於國際貿易地興 起,紅火蟻目前已於包含台灣在內多個國家中被發現並在當地造成危害。為了對抗紅 火蟻造成的影響,瞭解紅火蟻的基因將是個有效的方向。故希望從決定紅火蟻的性別 決定基因之候選位置中探索其重組率以更精準地定位性別決定基因的所在位置。本篇 研究選用紅火蟻其中兩條等位基因序列,分別標記為 H04、H07。對於紅火蟻來說,正常情況下單套個體將發育成雄蟻、雙套且為異型合子的個體將發育成為雌蟻(職蟻或處 女蟻后),然而同型合子個體則會發育為不孕的雙套體雄蟻。本實驗利用限制酶酵素切 位多樣性( Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP )技術,使用 MEGA 軟體將H04、H07 序列之同源序列做排序後,使用 Ape 軟體找出其候選酵素切位並篩選出於不同等位基因序列上具有多樣性之切位後,利用聚合酶鏈鎖反應( polymerase chain reaction, PCR )、酵素酶切割及電泳凝膠技術,找出理應為異型合子之雌蟻中只具有 H04 或 H07 序列其中一個訊號之個體,即代表該區域曾發生過基因體重組事件而應被排除出性別決定基因的候選位置。我們成功確認 H07、H04 的 90 個樣本中,同型合子共有12 個、異型合子共有 78 個,並且雄蟻皆只偵測到一個訊號,符合預設。未來繼續縮短範圍,直至找尋到決定紅火蟻重要基因序列。

In Silico Carotenoid Compound with Protein in Durian (Durio zibethinus Murr.) Seed Waste and Hedonic Test Innovation in Making Healthy Cereal Organic (HCO) (Nutrient-rich Functional Food Alternative)

Durians’ seeds have potential as a food source due to their content and nutrients. Durians’ seeds contain fiber, minerals, vitamins A, B1, B2, C, carbohydrates, folate, potassium and copper. Nutrients are needed for the body's health and growth and development process. Durians’ seeds have the potential as a nutrient-rich food alternative. Researchers made an innovation in the form of cereal, Healthy Cereal Organic (HCO). Analysis of durians’ seed content through two stages. First, wet lab examination and second, in silico method. The wet lab examination shows the results that durians’ seeds contain 10.17 Kcal of fat energy, 4.09% ash content, 11.25% water content, 72.79% carbohydrates, 1.13% total fat and 10.74% protein and the in silico method shows the content of carotenoid compounds (vitamin A, quercetin, beta-carotene, zeaxanthin) as a drug delivery system which means that this compound is able to be absorbed by the body with the help of albumin as a carrier that maintains stability and increases its activity. Feasibility analysis based on toxicity tests, Durians’ seed compounds show inactive (non-toxic) results. Allergenicity test showed non-allergen durians’ seed content. Hedonic test was conducted on 20 panelists dominant to the HCO1 sample for aroma by 60%, texture 90%, taste 40%. It can be concluded that durians’seeds can be used as a basic ingredient for making nutrient-rich Healthy Cereal Organic (HCO).