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In Silico Modeling of Lovastatin Analogues as Inhibitors of HIV-1 Nef Protein
Currently, no method can completely eliminate the human immunodeficiency virus (HIV) in an infected person. HIV employs an accessory protein called Nef that forms a complex with cellular AP-1, preventing detection of HIV-infected cells. Lovastatin has been recently identified to inhibit the formation of said Nef-AP-1 complex, but its effective concentration is remarked to be far higher than other Nef inhibitors. This study aims to develop a modified lovastatin molecule exhibiting higher binding affinity to the HIV-1 Nef protein than lovastatin in silico. Modified lovastatin molecules based on the interaction map of lovastatin with Nef were modeled, and flexible ligand-flexible receptor docking to the Nef binding site was performed using AutoDock Vina. Residues within the Nef binding site identified by Liu et al. (2019) to be crucial (Glu-63, Val-66, Phe-68, Asp-108, Leu-112, Tyr-115) were set as flexible. Fragment-based drug design was utilized to append molecular fragments to lovastatin in order to maximize its interactions with said crucial residues. From the fragment-based approach, molecule F4 ((1S,3S)‐8‐{2‐[(2R,4R)‐4‐chloro‐6‐oxooxan‐2‐yl]ethyl}‐3‐(hydroxymethyl)‐7‐methyl‐1,2,3,4‐tetrahydronaphthalen‐1‐yl 4‐aminobenzoate) exhibited a binding affinity of -9.0 kcal/mole, and its estimated IC50 ranges between 0.25-0.51 μM which is at least 7.5 times lower than the reported IC50 of lovastatin from literature. This study presents insights on the key modifications to improve lovastatin as an HIV-1 Nef inhibitor and pertinent information about the Nef binding site for future drug development studies.
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觀「茶」思維-酸柑茶中總酚含量與還原力之特性探討
茶湯中的兒茶素、多酚類等天然抗氧化劑其皆具有抗氧化活性,多酚類是茶湯中主要具有生物活性的成分。其中,客家酸柑茶屬於重發酵茶和老化茶的一種,又名為客家普洱茶。本實驗以1年、3年、5年、6年酸柑茶為研究主題,以茶種加工方式的不同及貯放年份作為研究方向,再以總酚含量測定及赤血鹽還原法進一步檢驗多酚含量與抗氧化活性變化。研究中發現,以3年酸柑青茶葉/果皮的總酚含量(444.22ppm/482ppm) 及赤血鹽還原力(471.83ppm/455.71ppm)所具備的抗氧化性最佳。訂定酸柑茶為主題分析意義,在於通過結合傳統客家文化精神與科學研究分析,期許能產生更大的文化經濟價值。
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The Reproduction success of the Cyprinidae and a Claridae fish species and its impact on small- scale fisheries
To investigate the reproduction success and natural recruitment of several Cyprinidae fish and Claridae fish species in the Allemanskraal Dam. The purpose of the project included investigating whether each individual fish species studied has a successful 2020/2021 spawning season in comparison with each other. Sections of the seine net were measured along with a distance of 10 along the shoreline. The ends of the seine nets were attached to one foot and the top of the net was held by hand. Both volunteers moved in unison while covering the 10m. The volunteer in the “deep end” moved towards the shoreline creating a semi-circle while the other volunteer remained stationary. The two ends of the net were then pulled onto the shore and the fish were collected. The results found that the Labeo Umbratus and Cyprinus carpio had the most successful spawning seasons with the highest recorded numbers. These high numbers of the Labeo Umbratus can be due to the fact that the species lays a large number of eggs. The high numbers of the Cyprinus carpio is due to the lower numbers of the other fish species as previous studies have shown that the species negatively impacts the environment which could in turn negatively impact the other fish species. The Claridae gariepinus and Labeobarbus aeneusas were the lowest. The low numbers of the Labeobarbus aneusas may be due to their slow growth and late maturity rate. The Labeo capensis had an average number relative to the other species and this is due to the fact that during the sampling period the dam was at 100% capacity as this is essential for the survival of the juvenile fish. The hypothesis was accepted as the Labeo Umbratus, Cyprinus carpio and Labeo capensis all have a successful spawning season. However, due to the size of the Cyprinus carpio, they would be most suited for a small scale fishery.
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跳豆為輕殼與重球組合而成,輕推能重複翻滾。本實驗分析其運動過程與模式。實驗中可發現跳豆不斷重複「殼平行斜面」與「殼翻轉」的運動模式。隨跳豆長度增加,「殼平行斜面」的鋼珠加速區變長,但翻轉時間也變長,導致飽和速度明顯較低,在有限斜坡長度下有最佳跳豆長度。本研究利用移動和轉動方程式得到翻轉期間鋼珠理論加速度,搭配實驗數據得出速度理論值與速度實驗值有相似的趨勢。隨著跳豆寬度越寬,跳豆翻轉期間鋼珠速度對時間由「V」型轉變成「W」型,出現二次加速段,且在有限斜坡距離下,跳豆有理想寬度。可翻滾的情況中,內球質量越小越快達飽和且加速減速變化量值較大。
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奶奶的AI銀翼天使~高齡社會老人積極老化的「心」嘗試
2019年COVID-19肆虐全球,老年人社交及運動頻率下滑。2023年本縣邁入超高齡社會,「下流老人」成社會隱憂!老人如何積極面對老化帶來生理、心理及社交變化呢?即便疫情也能有正常體能活動呢?本研究探討嘗試結合Google teachable machine及OpenPose的AI姿態辨識功能,透過Python編寫智能人機互動軟體,提高老人運動效率。除了生理積極抗老化,也希望心理、社交層面予以滿足。故,研究中結合華德福教育優律思美運動,藉由舞蹈、詩歌及優美旋律引導老人心靈、提升動機。最後以自覺量表來記錄運動強度,期望能建立正面積極的老化社會,AI智能將像天使銀翼讓奶奶能夠再次翱翔。
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色彩偏好影響生活的許多決策,對於背景對色彩偏好的影響,現行兩個色覺理論(對比理論與生態價理論)有不同的解釋,本研究以高中生為對象,旨在探討背景對色彩偏好影響與支持理論,並提出運用方向。 之前色彩定量方式缺乏對敏感度與視錐細胞的考量,本研究發展以中性灰為基礎對不同色彩的定量方法,並以此進行色彩偏好測試。實驗結果發現:顏色偏好會受到背景影響(支持對比理論),背景對各色彩具不同影響力,偏黃偏綠顏色受背景影響較大;綠色與藍色背景提升偏黃與偏綠之顏色偏好而紅色背景則會下降(支持生態價理論),背景亮度不影響顏色偏好。期望研究結果有助於青少年環境與產品設計配色參考,並對未來背景影響顏色的神經機制研究提供基礎。
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急酷降溫:開發水冷式CPU散熱模組之研究
目前水冷散熱系統普遍應用在電腦CPU降溫中,雖然水的「比熱容」比空氣及大部分介質都高,但因水冷散熱系統內冷卻液的熱量,最終仍靠風扇送到機殼外,故CPU之最低溫度仍存在一個臨界值。本研究旨在對於「一體式」與「分離式」電腦水冷散熱系統及「熱電致(製)冷晶片」(Thermoelectric Cooling Module)結合進行模組開發設計,將此兩類相關元件搭配結合,以突破傳統水冷式散熱所無法降達的溫度。本研究將「致(製)冷晶片」之致冷端及水冷系統作結合,利用致冷端作為吸收CPU主要熱量,結果發現:與單純只利用風扇將熱量帶走的方式相比,本研究所開發之『第一代』一體式散熱模組與『第二代』分離式散熱模組皆成功地將頂級CPU之工作溫度再壓低,使電腦工作效率維持在最佳範圍。
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芭蕾舞之無限旋轉——Fouetté turns物理剖析
芭蕾和物理有密不可分的關係,每個動作都能用物理原理來剖析。本報告對於無限旋轉─Fouetté turns進行討論,在有摩擦力的情況下,舞者為何能不斷的旋轉,必定是有得到新的角動量。而我們推論,舞者角動量的補充是來自旋轉時上下腳的動作配合,上腳伸直在外面畫圈時,下腳全踩,利用靜摩擦力產生新的角動量;而上腳收回時,下腳踮起,新的角動量使舞者維持旋轉。這樣一來一往,芭蕾舞者便能做出看似不可能、不合理的無限旋轉動作了。
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小茶種紅茶是我們家鄉的在地物產,結合學校課程特色,探究不同重量、不同季節和不同品種的紅茶沖泡出來的茶湯,發現經過冰箱冷藏後,僅有一部分產生茶乳現象(Tea Creaming),還發現溫度回升後會恢復清澈茶色。透過物理光學觀測試著找出茶乳現象的臨界時間,此時所對應之環境溫度、茶沖泡濃度與茶品種關係,預計未來能夠作為評斷好茶的一種輔助工具。 研究中發現,不是所有的茶都會有茶乳現象,只有觀察到紅茶會產生現象。其次,觀察到茶乳現象之紅茶濃度需足夠才會產生茶乳現象,其中觀察到夏茶產生茶乳現象明顯、冬茶則無。最後透過不同茶種,觀察到小葉種紅茶會產生現象,大葉種紅茶則未觀察到。期望讓品嘗紅茶的愛好者,未來多一個紅茶能夠參考其價值之依據。
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本研究的啟發主要是由於2021年台灣發生嚴重缺水危機,引起我們去探究是否有方法可以讓校園內打掃拖地使用後的拖地汙水得到過濾淨化,以便我們能將拖地使用後的汙水進行回收再利用。 本研究的目的是利用校內可以取得的材料,來製作濾水裝置,且我們的濾水裝置不同於常見的重力濾水方式,而是以纖維材料藉由毛細現象來完成過濾水質的效果,並製作一組簡易水質濁度檢測機來檢驗水質,發現自製濁度機照度數值愈小,水質愈混濁;照度數值愈大,水質愈乾淨。 研究結果發現使用簡易纖維材料對汙水進行過濾或許是可行且低成本的方法,且我們藉由各項實驗的數據發現,不同的濾材設定會對於濾水效果造成不同的影響,並使用我們自製的濁度儀器來確認結果。
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本實驗探討如何於居家環境中進行簡易廢熱利用,以達到節能目的—透過熱水降溫時所釋放出來廢熱,提高冷水溫度,並嘗試熱電效應將廢熱轉換成電能利用。 為了達到冷水溫度上升最多且所需時間最少的效果,我們嘗試許多實驗,最終發現利用保麗龍箱減少熱能散失,且使用少量水做為傳熱介質,再加上抽水馬達促進介質的循環效果最好,最高可在30分鐘內節省超過30%的能源。其他嘗試方法大多也能達到至少10%節能效果。若利用熱電效應回收廢熱,受限於熱電晶片現今技術,其回收效率不甚理想,最佳回收率僅約0.2%。 經以上實驗結果可知,在準備烹煮下一餐前,提早約30至90分鐘進行簡單廢熱利用,即有良好節能減碳效果,為環境盡一份心力。
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本研究源於 2022 年數學雜誌《Crux Mathematicorum》的一道四邊形動態幾何問題,我們先將此問題設定為三角形,利用綜合幾何方法給出了兩種構圖條件下的三角形外心軌跡皆為圓弧,並且發現兩種圓弧的變換關係,也給出豐富有趣的性質。值得一提的是,分別對三角形的三個頂點輪換進行第一種構圖得出三個圓弧,這些圓弧恰可組合成三角形的九點圓,這是有趣的發現!回到原始問題的四邊形,我們構造了兩個三角形,透過巧妙轉換頂角與直徑圓變換而給出外心軌跡所在圓弧的兩個定點而解決此問題。最後推廣至鄰邊連線時,我們用雙射對應觀點簡潔刻劃了軌跡圓弧。重要的是,本研究處理四邊形的手法與三角形的是一致的,意味著證明手法具有推廣性。
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