台灣萍蓬草生長環境為弱鹼性水質、砂質壤土，半日照以上光線；植株以浮水葉為主，另有少許的沉水葉，葉子的向光性很明顯。繁殖可用種子傳播，亦可用地下走莖擴大其族群；傳粉方式以蟲媒為主。台灣萍蓬草開花平均需要6.47 天的時間；結果平均需要17.88 天，結果率約52％；其花苞不論水位如何變化，花莖一定生長高出水面6 公分以上才開花。若缺乏光照，會延遲開花達7 天；若給予24 小時光照，不會提前開花。同一走莖生長之植株，一次只會有一個花苞挺出水面開花，可避免自花受粉的情況。果實中含有凝膠，可以保護種子不腐爛、吸引魚類覓食，然後再藉由排泄讓種子散播、擴大生長的區域。台灣萍蓬草為浮水性植物，日本萍蓬草則為挺水性植物；台灣萍蓬草柱頭為紅色，日本萍蓬草柱頭為黃色。
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